Les eaux souterraines contribuent de façon significative à l'alimentation en eau douce des milieux lagunaires et estuariens, il est donc fondamental de bien connaitre leur état qualitatif tout comme les flux concernés.
Ceci est particulièrement vrai dans le cas de l'étang de Biguglia, situé au Sud de Bastia au niveau d'une zone à fort développement commercial, industriel et résidentiel, source de nombreuses pollutions potentielles. Ces flux polluants peuvent de façon sournoise, mais certaine, joindre les eaux de la lagune par l'intermédiaire des circulations souterraines et ainsi contribuer au déséquilibre écologique de cet écosystème à haute valeur biologique.
Les outils géochimiques et isotopiques permettent de tracer précisément ces flux polluants et vont également permettre de préciser les conditions exactes de vulnérabilité de l'ensemble de la plaine littorales vis à vis de ce risque. Ceci permettra à l'avenir de limiter au maximum l'apport de substances néfastes pour l'ensemble lagunaire et constituera une aide à la prise de décision par les gestionnaires.
